Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms