Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C4orf17Q53FE4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms