Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LAMA3Q16787 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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