Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms