Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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