Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOMM20Q15388 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOMM20Q15388 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms