Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms