Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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CHD4Q14839 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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