Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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