Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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