Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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