Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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