Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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