Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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