Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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