Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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