Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms