Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFCP2Q12800 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFCP2Q12800 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms