Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FMODQ06828 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FMODQ06828 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FMODQ06828 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FMODQ06828 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms