Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms