Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms