Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms