Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms