Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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NEK3P51956 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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NEK3P51956 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NEK3P51956 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NEK3P51956 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NEK3P51956 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NEK3P51956 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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