Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC3P51654 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC3P51654 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC3P51654 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC3P51654 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms