Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms