Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NESP48681 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NESP48681 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NESP48681 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms