Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms