Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBRP36941 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBRP36941 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.5 ms