Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBP1P32455 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBP1P32455 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBP1P32455 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBP1P32455 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBP1P32455 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBP1P32455 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP1P32455 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP1P32455 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBP1P32455 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP1P32455 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP1P32455 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBP1P32455 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms