Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC3AP31941 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms