Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms