Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC025580.1-201ENST00000559553 729 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CXorf21-201ENST00000378962 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms