Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms