Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRHP20396 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRHP20396 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRHP20396 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms