Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms