Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms