Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL3O95573 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms