Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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ACSL4O60488 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ACSL4O60488 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ACSL4O60488 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ACSL4O60488 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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ACSL4O60488 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ACSL4O60488 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ACSL4O60488 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ACSL4O60488 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ACSL4O60488 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ACSL4O60488 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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