Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPRTO14522 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPRTO14522 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPRTO14522 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPRTO14522 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTPRTO14522 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPRTO14522 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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