Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms