Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRRT4C9JH25 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms