Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms