Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REXO2Q9Y3B8 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms