Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms