Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CPNE7Q9UBL6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CPNE7Q9UBL6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CPNE7Q9UBL6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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