Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms