Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CISHQ9NSE2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms