Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms