Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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